| 單位名稱 | 電話 | 傳真 | 地址 | 電子郵件信箱 |
| 東區衛生所 | 06-2674085 | 06-2672391 | 70151臺南市林森路一段418號 | |
| 南區衛生所 | 06-2618578 | 06-2618771 | 70261臺南市南和路6號 | |
| 中西區衛生所 | 06-2252403 | 06-2217163 | 70054臺南市環河街94號 | |
| 北區衛生所 | 06-2252404 | 06-2248702 | 70449臺南市西華街50號 | |
| 安平區衛生所 | 06-2996885 | 06-2992209 | 70843臺南市安平區平通里育平路310號 | |
| 安南區衛生所 | 06-2567406 | 06-2559569 | 70960臺南市仁安路70號 | |
| 仁德區衛生所 | 06-2704153 | 06-2797311 | 71742臺南市仁德區仁德里中山路606巷2號 | |
| 歸仁區衛生所 | 06-2393309 | 06-2395112 | 71147臺南市歸仁區中正北路1段1號 | |
| 關廟區衛生所 | 06-5952395 | 06-5961364 | 71846臺南市關廟區山西里中正路1000號 | |
| 龍崎區衛生所 | 06-5941397 | 06-5940080 | 71942臺南市龍崎區崎頂里新市子158號 | |
| 永康區衛生所 | 06-2326507 | 06-2012778 | 71089臺南市永康區文化路51號 | |
| 新化區衛生所 | 06-5905398 | 06-5901314 | 71247臺南市新化區健康路143號 | |
| 善化區衛生所 | 06-5837035 | 06-5850354 | 74154臺南市善化區中山路200號 | |
| 新市區衛生所 | 06-5992504 | 06-5011581 | 74447臺南市新市區中興街12號 | |
| 安定區衛生所 | 06-5922022 | 06-5920340 | 74544臺南市安定區安定里59號之1 | |
| 山上區衛生所 | 06-5781013 | 06-5782382 | 74341臺南市山上區山上里35-2號 | |
| 玉井區衛生所 | 06-5742275 | 06-5746752 | 71445臺南市玉井區中正路5號 | |
| 楠西區衛生所 | 06-5751006 | 06-5751709 | 71542臺南市楠西區中正路226號 | |
| 南化區衛生所 | 06-5771139 | 06-5773043 | 71642臺南市南化區南化里226之1號 | |
| 左鎮區衛生所 | 06-5731114 | 06-5731685 | 71341臺南市左鎮區中正里172-15號 | |
| 麻豆區衛生所 | 06-5722215 | 06-5712478 | 72148臺南市麻豆區興國路11之1號 | |
| 下營區衛生所 | 06-6892149 | 06-6896981 | 73541臺南市下營區營前里中山路二段137號 | |
| 六甲區衛生所 | 06-6982013 | 06-6990410 | 73442臺南市六甲區中華路110號 | |
| 官田區衛生所 | 06-5791493 | 06-5790400 | 72041臺南市官田區隆田里中山路1段128號 | |
| 大內區衛生所 | 06-5761044 | 06-5761114 | 74247臺南市大內區大內里2號 | |
| 佳里區衛生所 | 06-7224106 | 06-7213709 | 72252臺南市佳里區進學路159號 | |
| 西港區衛生所 | 06-7952338 | 06-7956465 | 72341臺南市西港區中山路368號 | |
| 七股區衛生所 | 06-7872277 | 06-7872339 | 72441臺南市七股區大埕里379號 | |
| 將軍區衛生所 | 06-7942007 | 06-7942052 | 72544臺南市將軍區忠興里185之6號 | |
| 北門區衛生所 | 06-7862043 | 06-7861375 | 72742臺南市北門區永隆里50號 | |
| 學甲區衛生所 | 06-7833359 | 06-7820105 | 72645臺南市學甲區建國路38號 | |
| 新營區衛生所 | 06-6355696 | 06-6329910 | 73049臺南市新營區三民路72號 | |
| 鹽水區衛生所 | 06-6521041 | 06-6527218 | 73747臺南市鹽水區武廟路1號 | |
| 白河區衛生所 | 06-6852024 | 06-6832485 | 73242臺南市白河區永安里國光路5號 | |
| 柳營區衛生所 | 06-6220464 | 06-6223845 | 73656臺南市柳營區士林里54-5號 | |
| 後壁區衛生所 | 06-6872624 | 06-6872249 | 73143臺南市後壁區後壁里3號 | |
| 東山區衛生所 | 06-6802618 | 06-6801457 | 73343臺南市東山區東山里236號 | |